Ақпарат

ПТР және кең ауқымды ПТР

ПТР және кең ауқымды ПТР


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Мен 50 мкл ПТР жүргіздім, ол гельдік электрофорезде айқын жолақты көрсетті. Содан кейін мен 3650 мкл ауқымды ПТР жүргіздім, ол гель электрофорезінде анық емес жолақты көрсетті. Бұған не себеп болуы мүмкін? Бұл жолақ бар болса да, өте түсініксіз болса да, бұл плазмидтердің жоғалуы болуы мүмкін бе? Айта кету керек, бір реттік ПТР жазда жасалды, ал қазір ауқымды


Мен үлкен масштабты сұңқар түтігінде жасадым, содан кейін қоспаны әрқайсысы 50 мкл бар ПТР түтіктеріне ауыстырдым, сондықтан ПТР шарттары жалғыз ПТР күшейтуімен бірдей болуы керек.

Егер барлық реагент концентрациясы мен айналым шарттары бірдей болса, 50 мкл аликвоттар ретінде жіберу алдында үлкен көлемді реакцияңызды жеткілікті түрде араластырмадыңыз деп ойлаймын.

Айта кету керек, бір реттік ПТР жазда жасалды, ал қазір ауқымды

Кіші және үлкен көлемді реакциялар үшін бірдей полимераза мен праймер қорларын пайдалансаңыз, қорлар аралықта дұрыс сақталды ма? Глицерин буферлеріндегі рекомбинантты ДНҚ полимеразаларының сақтау мерзімі жеткізушінің сипаттамаларына және сақтау шарттарына байланысты айдан жылдарға дейін созылады, дегенмен бірнеше айдан кейін белсенділіктің төмендеуін күту керек.


Туа біткен токсоплазмоздың молекулярлық диагностикасы үшін коммерциялық жинақ пен екі зертханада жасалған ПТР талдауының салыстырмалы бағасы

Токсоплазмоз - бұл ауыр ауруды тудыруы мүмкін дүниежүзілік инфекция және Францияда ауыр денсаулық мәселесі ретінде қарастырылады. Ауруды диагностикалау үшін паразитті молекулалық әдістермен анықтау өте маңызды. Toxoplasma ПТР талдауларының әдістері мен көрсеткіштерінің өте әртүрлілігі коммерциялық ПТР жинақтарын пайдалануды тартымды балама етеді, өйткені олар стандарттау мүмкіндігін ұсынады. Біз амниотикалық сұйықтықта Toxoplasma gondii ДНҚ анықтаудың үш молекулалық әдісінің көрсеткіштерін салыстырдық: кірістірілген ПТР пайдаланатын коммерциялық әдіс және зертханада әзірленген екі әдіс, бірі кәдімгі ПТР және екіншісі нақты уақыттағы ПТР. Бұл бағалау T. gondii ДНҚ сериялық сұйылту талдауына, әр түрлі концентрацияларда T. gondii қосылған амниотикалық сұйықтықтың үш үлгісіне және 33 амниотикалық сұйықтық үлгісінен тұратын клиникалық когортаға негізделген. T. gondii ДНҚ сериялық сұйылту талдауы зертханада әзірленген әдістерге қарағанда коммерциялық жинақ үшін әлдеқайда төмен сезімталдықты көрсетті. Сонымен қатар, дәлелденген 12 туа біткен токсоплазмоз жағдайының 91,7% зертханалық талдаулар арқылы анықталған, ал коммерциялық жинақпен тек 50% анықталған. Әдістің сезімталдығының болмауы, ішінара ПТР ингибиторларының болуына байланысты, коммерциялық әдістің негізгі кемшілігі болды. Бұл зерттеу коммерциялық ПТР диагностикалық жинақтары мұқият оңтайландырылған зертханалық әзірленген әдістерге қарағанда жүйелі түрде жақсырақ жұмыс істемейтінін атап көрсетеді. Мұндай жинақтарды білікті топтардың мұқият бағалауы қажет, сондай-ақ денсаулық сақтау провайдерлері таңдағандарға сенімділікті арттыру үшін коммерциялық жинақтарды сынауға болатын өнімділік стандарттары қажет.


Қол жеткізу опциялары

1 жылға толық журналға қол жеткізіңіз

Барлық бағалар NET бағалары болып табылады.
ҚҚС кейінірек кассада қосылады.
Салықты есептеу тексеру кезінде аяқталады.

ReadCube қолданбасында шектеулі уақытқа немесе толық мақалаға қол жеткізіңіз.

Барлық бағалар NET бағалары болып табылады.


ПТР биосистемалары молекулалық биологияны зерттеу және диагностикалау үшін ПТР жинақтары мен реагенттерін әзірлейді және шығарады. Саладағы 20 жылдан астам тәжірибеден кейін, тең құрылтайшылар Марк Стивенс пен Алекс Уилсон 2012 жылы компанияны басқаша әрекет ету мақсатында ашты. Тұтынушылардың зерттеулерін жеңілдететін өнімділігі жоғары ПТР реагенттерін және серіктестерге диагностикалық талдауды әзірлеуге қолдау көрсету үшін дәлдік құрамдастарын құру басты назарда болды.

Енді, тоғыз жыл өткен соң, ПТР Biosystems компаниясында ПТР қолданбаларының кең спектрін қамтитын меншікті талдаулар мен смарт экран технологиясы арқылы жасалған реагенттер портфолиосы бар. Маңыздысы, ПТР Biosystems сонымен қатар ISO 13485:2016 сертификатталған сапа менеджменті жүйесі бойынша жұмыс істейді, бұл өнімдер мен процестер медициналық құрылғы компоненттерін өндірудің халықаралық стандарттарына сәйкес келетінін білдіреді.

Пандемия кезінде ПТР-ға көп көңіл бөлінді. qPCRBIO Probe 1-Step Virus Detect жаңа өніміңіз, оның іске қосылуы және оны не үшін пайдалануға болатыны туралы айтып беріңіз.

Алекс: «qPCRBIO Probe 1-Step Virus Detect SARS-CoV-2 (COVID-19-ға жауапты вирус) үшін жоғары өнімділік тестін қолдау үшін пандемияның басында іске қосылды. Бұл өнім вирустық РНҚ тізбегін жылдам және дәл анықтауға арналған жоғары концентрациялы 4x RT-qPCR жинағы. Тек тампон сығындысы мен сумен бірге арнайы праймерлер мен зондтарды қосу қажет. Пайдаланушылар үшін маңызды артықшылық - шағын көлемді реакциялармен жұмыс істегенде де аналитикалық сезімталдықты арттыру үшін реакцияларына көбірек үлгі қосу мүмкіндігі.

qPCRBIO Probe 1-Step Virus Detect құралын жасау арқылы біз зерттеушілер мен диагностикалық жинақ өндірушілеріне талдауды әзірлеуде икемділік пен алынған нәтижелердің сапасы мен дәлдігіне сенімділікті ұсынуды мақсат етеміз.

ПТР биожүйелері COVID-19-мен күресті қолдауға тағы қалай көмектесті?

Алекс: «Өздеріңіз елестетіп отырғандай, дағдарыстың ауырлығына байланысты жылдам және сенімді реагенттерге сұраныс төбеден өтті. qPCRBIO Probe 1-Step Virus Detect-тен басқа, біздің пандемия алдындағы портфолиомызда COVID-19 сынағы үшін пайдалануға болатын бірқатар өнімдер бар және біз осы маңызды реагенттердің өндірісін бірден ұлғайттық.

Жаппай ауқымда тестілеуді қолдау үшін біз клиникалық үлгілерді жоғары өткізу қабілеттілігімен сынау үшін консистенцияны, ыңғайлылықты және құндылықты қамтамасыз ететін негізгі өнімдеріміздің жаппай пакеттік өлшемдерін енгіздік. Оған қоса, Charité, Berlin және CDC ұсынған праймер-зонд тізбегі (RdRp, E және N гендері) арқылы SARS-CoV-2 нуклеин қышқылын сапалы анықтау үшін qPCRBIO Probe 1-Step диапазонымызды растадық. Талдауды әзірлеу және масштабтау бойынша техникалық тәжірибесі бар тұтынушыларға қолдау көрсету өткен жылдағы біздің команда үшін тағы бір басты назар аударды.

Пандемияның ортасында біз тапсырыс беруші Riboshield's RNase ингибиторын тәуелсіз өнім ретінде жеткізе бастадық. Бұл реагент РНҚ-ны қорғайды және үлгілердегі SARS-CoV-2 сияқты РНҚ нысандарын тұрақтандырады, осылайша сенімді диагностикалық нәтижелерді қамтамасыз етеді.

Жақында біз вирустық РНҚ-ны күшейту және талдау үшін ПТР-ге балама әдісті қамтамасыз ететін IsoFast™ Bst 1-Step Mix-ті іске қостық. Нуклеин қышқылының тізбектерін ауыстыру мүмкіндіктері арқылы Bst полимераза дәстүрлі Taq ферменттерімен байланысты жоғары температуралық денатурация қадамының қажеттілігін жояды. Бұл нәтижеге тезірек жетуге мүмкіндік береді және арнайы термоциклдік жабдықсыз далада арзан анықтауды жеңілдетеді ».

Пандемияға байланысты көптеген жеткізу тізбегі үзілгенімен, ПТР биожүйелері үздіксіз жеткізуді қамтамасыз ету үшін операцияларды кеңейтуді және оңтайландыруды қалай жалғастырды?

Алекс: «Пандемия басталғаннан бері біз барлық нарықтардағы зерттеушілер мен ұйымдарға қажетті ПТР өнімдері мен қызметтеріне қол жеткізуді қамтамасыз етуге міндеттендік. Шапшаң және жылдам жауап беру осы уақыт ішінде алынған кез келген реагент тапсырысын орындау қабілетімізге көмектесті – бұл мен үшін мақтаныш.

Төтенше жағдайларды жоспарлаудың арқасында біз дереу өндіріс, құрастыру және тапсырыстарды орындау үшін ауысымдық жұмысты енгіздік және операциялық қолдау көрсету үшін резервте толық дайындалған екі коммерциялық топ бар аптасына жеті күн жұмыс істейтін үш жеке бригада болды.

Біз RT-qPCR реагенттерінің өндірісін ауқымды түрде арттырдық және пластикалық бұйымдардың тапшылығын мойындай отырып, тұтынушыларымызды жаппай форматтарға бағыттадық. Жабдықтаушылармен тамаша қарым-қатынаста болу өте маңызды болды және біздің бизнесті ғана емес, сонымен қатар маңызды жеткізушілеріміздің бизнесін кеңейту осы процестегі маңызды қадам болды.

Біздің кеңейтілген өндірістік қуаттарымыз, үлкен қор қорлары, одан әрі кеңейту мүмкіндігі және ПТР сарапшылар тобының үлкен ұлғаюы арқылы біз реагенттерді үздіксіз жеткізу жөніндегі міндеттемемізді орындай алдық және біз кез келген мәселені шешуге дайынбыз. болашақта сұраныстың өсуі».

ПТР биожүйелерін болашақта не күтіп тұр?

Алекс: «Біз ғылыми-зерттеу және тәжірибелік-конструкторлық қызметімізге ауқымды инвестиция салып, өнімді дамытудың үлкен құбырын алға жылжыту арқылы болашақ жоспарларымызбен өршілміз. Ағымдағы пандемияға да, одан кейін де ұзақ мерзімді перспектива тұрақтылық пен сенімділікті ұсынатын диагностикалық және молекулалық реагенттерге оңай қол жеткізуді жеңілдету болып табылады, әсіресе медициналық көмек көрсету нүктелері үшін. Осы мақсатта біз жақында Lyo-Ready ПТР реагенттерінің ауқымын іске қосамыз. Бұл өнімдерді лиофилизациялауға болады – қатты пішінге дейін кептіру процесі, тасымалдау мен сақтауды жеңілдетеді, өнімнің қызмет ету мерзімін арттырады және үлгі көлемінде үлкен икемділікке мүмкіндік береді.

Біз сонымен қатар 2021 жылға дейін және одан кейінгі кезеңге көшу барысында дистрибьюторлық серіктестікті және диагностикалық ынтымақтастықты кеңейтуді жалғастырамыз. COVID-19 сынау реагенттері үшін күресте біз кейбір аймақтардың жеткізушілерінен қажетті материалдарды қамтамасыз ете алмағанын білеміз. Біз 39 елдегі тұтынушыларға реагент қажеттіліктеріне қолдау көрсететін тәжірибелі дистрибьюторлық желіден үлкен пайда алдық. Біздің жаһандық денсаулық сақтау жүйелерін қажетті өнімдермен және тәжірибемен қамтамасыз ету жөніндегі міндеттемеміз ПТР биосистемасының келешекте де берік болып қала береді.

Қосымша ақпарат алу үшін Ұлыбританияның бас кеңсесіне + 44 (0) 20 3930 8101, [email protected] электрондық поштасына хабарласыңыз немесе www.pcrbio.com сайтына кіріңіз.

Назар аударыңыз: бұл коммерциялық профиль

© 2019. Бұл жұмыс лицензия бойынша лицензияланған CC BY 4.0 лицензиясы.


ПТР және рестриктеуші ферментті дайджесттерге кең ауқымды енгізу үшін сұрау негізіндегі эксперименттер

Хат алмасу мекенжайы: Луизиана Ксавье университетінің химия факультеті, 1 Дрексел. Доктор, Жаңа Орлеан, LA 70125, АҚШ. E-mail: [email protected] [email protected] .Осы автордың басқа мақалаларын іздеңіз

Химия кафедрасы, Луизиана Ксавье университеті, 1 Дрексел. Доктор, Жаңа Орлеан, Луизиана, 70125

KEJ және TJW бұл жұмысқа бірдей үлес қосты.

Хат алмасу мекенжайы: Луизиана Ксавье университетінің химия факультеті, 1 Дрексел. Доктор, Жаңа Орлеан, LA 70125, АҚШ. E-mail: [email protected] [email protected] .Осы автордың басқа мақалаларын іздеңіз

Химия кафедрасы, Луизиана Ксавье университеті, 1 Дрексел. Доктор, Жаңа Орлеан, Луизиана, 70125

KEJ және TJW бұл жұмысқа бірдей үлес қосты.

Хат алмасу мекенжайы: Луизиана Ксавье университетінің химия факультеті, 1 Дрексел. Доктор, Жаңа Орлеан, LA 70125, АҚШ. E-mail: [email protected] [email protected] .Осы автордың басқа мақалаларын іздеңіз

Химия кафедрасы, Луизиана Ксавье университеті, 1 Дрексел. Доктор, Жаңа Орлеан, Луизиана, 70125

KEJ және TJW бұл жұмысқа бірдей үлес қосты.

Хат алмасу мекенжайы: Луизиана Ксавье университетінің химия факультеті, 1 Дрексел. Доктор, Жаңа Орлеан, LA 70125, АҚШ. E-mail: [email protected] [email protected] .Осы автордың басқа мақалаларын іздеңіз

Аннотация

Полимеразды тізбекті реакция және рестрикциялық эндонуклеаза дайджесті барлық биохимия және молекулалық биология зертханасының оқу бағдарламаларына енгізілуі тиіс маңызды әдістер болып табылады. Бұл әдістер көбінесе жоғары деңгейде оқытылады, студенттер мен оқытушылардың көп сағаттарын қажет етеді. Мұнда біз кіріспе зертханалық курстарға арналған және екі әдісті біріктіретін екі сұрауға негізделген экспериментті ұсынамыз. Екі тәсілде де студенттер ПТР өнімінің өлшемі мен шектеу дайджест үлгісінің тіркесіміне негізделген белгісіз ДНҚ тізбегінің, не ген тізбегі немесе праймер тізбегі сәйкестігін анықтауы керек. Эксперименттік дизайн икемді және нұсқаушыны дайындаудың қол жетімді уақыты мен ресурстары негізінде бейімделуі мүмкін және екі тәсіл де көптеген студенттерді қабылдай алады. Біз бұл эксперименттерді курстарымызда жалпы саны 584 студентке енгіздік және 85% табыстылық көрсеткішіне ие болдық. Жалпы алғанда, студенттер эксперименттік тақырыптарды түсінудің, алынған мәліметтерді түсіндіру қабілетінің және жалпы зертханалық дағдыларды меңгерудің жоғарылауын көрсетті. © 2015 Халықаралық биохимия және молекулалық биология одағы, 43:441–448, 2015 ж.

Қосымша анықтамалық ақпаратты осы мақаланың онлайн нұсқасында табуға болады.

Назар аударыңыз: Баспагер авторлар берген кез келген қолдаушы ақпараттың мазмұны немесе функционалдығы үшін жауапты емес. Кез келген сұраулар (жоғалған мазмұннан басқа) мақаланың сәйкес авторына жіберілу керек.


Екі коммерциялық ұзақ олигонуклеотидті микромассивтерден ген экспрессиясын өлшеуге арналған кең ауқымды нақты уақыттағы ПТР валидациясы

Фон: ДНҚ микромассивтері тез ашуға негізделген геномдық және биомедициналық зерттеулердің іргелі құралына айналуда. Дегенмен, әртүрлі технологиялар мен деректерді талдау мен интерпретациялаудың стандартты емес әдістерінің болуына байланысты микромассив нәтижелерінің сенімділігі күмән тудырады. Геннің экспрессиясын өлшеуге арналған «алтын стандарт»/«анықтамалық әдіс» болмағандықтан, әртүрлі микромассив платформаларының өнімділігін бағалайтын және салыстыратын зерттеулер көбінесе субъективті және қарама-қайшы қорытындыларды берді. Бұл мәселені шешу үшін біз TaqMan генінің экспрессиялық талдауына негізделген нақты уақыттағы ПТР тәжірибесін жүргіздік және бұл деректер жинағын екі өкілді коммерциялық микромассив платформаларының өнімділігін бағалау үшін сілтеме ретінде пайдаландық.

Нәтижелер: Бұл зерттеуде біз адам үш ұлпасының: ми, өкпе, бауыр және бір әмбебап адам анықтамалық үлгісінің (UHR) екі коммерциялық ұзақ олигонуклеотидті микромәліметтер платформасын пайдалана отырып, гендік экспрессиялық профильдерін талдадық: (1) Қолданбалы биожүйелердің адам геномына шолу микромассивтері (негізінде бір түсті анықтау бойынша) (2) Agilent Whole Human Genome Oligo Microarrays (екі түсті анықтауға негізделген). TaqMan ген экспрессиясының талдауына негізделген нақты уақыттағы ПТР валидациясы үшін гендік экспрессия деңгейлеріндегі кең динамикалық диапазонды қамтитын және микромассив платформаларымен ұсынылған 1 375 ген таңдалды. Әрбір платформа үшін әрбір өндірушінің стандартты хаттамаларына сәйкес бірдей жалпы РНҚ үлгілерінде төрт техникалық қайталау орындалды. Agilent массивтері үшін салыстырмалы будандастыру ми/өкпе/бауыр РНҚ үшін Cy5 және UHR РНҚ (жалпы анықтама) үшін Cy3 қосу арқылы орындалды. Анықтамалық жиын ретінде TaqMan ген экспрессиясының талдауына негізделген нақты уақыттағы ПТР деректер жинағын пайдаланып, екі микромассив платформасының өнімділігі келесі критерийлерге назар аудара отырып бағаланды: (1) өрнекті анықтаудағы сезімталдық пен дәлдік (2) бүктеудің өзгеру корреляциясы жұптық тіндердегі, сондай-ақ барлық тіндер бойынша анықталған ген экспрессиялық профильдеріндегі нақты уақыттағы ПТР деректері (3) Дифференциалды экспрессияны анықтаудағы сезімталдық және дәлдік.

Қорытынды: Біздің зерттеуіміз нақты уақыттағы ПТР технологиясына негізделген TaqMan гендік экспрессия талдауы арқылы ген экспрессиясын өлшеудің ең үлкен «анықтамалық» деректер жинағын қамтамасыз етеді. Бұл деректер жиынтығы әртүрлі микромассив платформаларының өнімділігін бағалау үшін балама ген экспрессия технологиясын пайдалануға мүмкіндік берді. Біз микромассивтер гендік экспрессияның скринингі үшін қолайлы сенімділігі бар баға жетпес ашу құралдары болып табылады деген қорытындыға келдік, дегенмен ген экспрессиясындағы болжамды өзгерістерді тексеру орынды болып қала береді. Біздің зерттеуіміз сонымен қатар микромассивтердің шектеулерін сипаттайды, бұл шектеулерді түсіну зерттеушілерге микромассив нәтижелерін анағұрлым сақтықпен және сәйкесінше тиімдірек бағалауға мүмкіндік береді.


ПТР реагенттері және ферменттері

ПТР тарихы, орнату туралы ойлар, ДНҚ-полимераза таңдауының маңыздылығы, жалпы әдістер мен қолданбалар және ақауларды жою туралы біліңіз.


Алғыс

Біз А.Боэмге Стэнфорд Р.Мартоне мен Л.Сасубрде тәжірибелік дизайн туралы пайдалы әңгімелері үшін түсінік және зертханалық қолдау көрсеткені үшін Офелия К.Ромеро-Марачини, М.Маттиоли және Д.Лиге техникалық қолдау көрсеткені үшін О.Шелтон, Дж.Самхуриге алғыс айтамыз. , Г.Уильямс, С.Хеннесси, А.Стиер, Б.Фейст және П.Левин қатысты аналитикалық талқылаулар мен далалық қолдау үшін Р.Моррис пен В.Армбрусту UW және Хелен Р.Уайтли орталығындағы зертханалық қолдау үшін. Бұл өнімді айтарлықтай жетілдіретін жазу шеберханасын қолдау үшін Friday Harbor Laboratories. Бұл жұмыс Дэвид пен Люсиль Пакард қорының грантымен қолдау тапты.


Жоғары дәлдіктегі полимераза дұрыс негіздің салынғанын қалай қамтамасыз етеді?

Дәлдігі жоғары ДНҚ полимеразаларында ДНҚ-ны көшіру кезінде қателер жасаудан және таратудан қорғау үшін бірнеше қорғаныс бар. Мұндай ферменттер полимерлеу кезінде дұрыс емес нуклеозидтрифосфатқа қарсы маңызды байланыстыру артықшылығына ие. Егер дұрыс емес нуклеотид полимераздың белсенді орнында байланысса, белсенді торап кешенінің оңтайлы емес архитектурасына байланысты қосылу баяулайды. Бұл кешігу уақыты дұрыс емес нуклеотидтің полимераза прогрессиясының алдында диссоциациялану мүмкіндігін арттырады, осылайша процесті дұрыс нуклеозидтрифосфатпен (1,2) қайта бастауға мүмкіндік береді. Егер дұрыс емес нуклеотид енгізілсе, тексеретін ДНҚ полимеразаларында қосымша қорғаныс сызығы болады (1-сурет). Қате жұпталмаған негіздер тудырған бұзылулар анықталады және полимераза өсіп келе жатқан ДНҚ тізбегінің 3&өткір ұшын 3´&rarr5&өткір экзонуклеаза доменіне жылжытады. Онда дұрыс емес нуклеотид 3&rarr5& өткір экзонуклеаза белсенділігі арқылы жойылады, содан кейін тізбек қайтадан полимеразалық доменге ауысады, онда полимерлену жалғасуы мүмкін.


Анықтамалар

Hackett JL, Lesko LJ: Microarray деректері - АҚШ FDA, өнеркәсіп және академия. Nat Biotechnol. 2003, 21 (7): 742-743. 10.1038/nbt0703-742.

Petricoin EF, Hackett JL, Lesko LJ, Puri RK, Gutman SI, Chumakov K, Woodcock J, Feigal DWJ, Zoon KC, Sistare FD: Microarray технологияларының медициналық қолданулары: реттеуші ғылымның перспективасы. Нат Генет. 2002, 32 Suppl: 474-479. 10.1038/ng1029.

Рамасвами С: Қатерлі ісік геномикасын клиникалық онкологияға аудару. N Engl J Med. 2004, 350 (18): 1814-1816 жж. 10.1056/NEJMp048059.

Shi L, Tong W, Goodsaid F, Frueh FW, Fang H, Han T, Fuscoe JC, Casciano DA: QA/QC: микромассив қауымдастығы мен реттеуші агенттіктердің алдында тұрған қиындықтар мен қателіктер. Сарапшы Аян Мол Диагн. 2004, 4 (6): 761-777. 10.1586/14737159.4.6.761.

Irizarry RA, Warren D, Spencer F, Kim IF, Biswal S, Frank BC, Gabrielson E, Garcia JG, Geoghegan J, Germino G, Griffin C, Hilmer SC, Hoffman E, Jedlicka AE, Kawasaki E, Martinez-Murillo F, Morsberger L, Lee H, Petersen D, Quackenbush J, Scott A, Wilson M, Yang Y, Ye SQ, Yu W: Microarray платформаларын бірнеше зертханалық салыстыру. Nat әдістері. 2005, 2 (5): 345-350. 10.1038/nmeth756.

Larkin JE, Frank BC, Gavras H, Sultana R, Quackenbush J: Microarray платформаларындағы тәуелсіздік және қайталану мүмкіндігі. Nat әдістері. 2005, 2 (5): 337-344. 10.1038/nmeth757.

Rogojina AT, Orr WE, Song BK, Geisert EEJ: Affymetrix қолдануын екі ретинальды пигменттік эпителий жасушаларының сызығын пайдалана отырып, нүктелі олигонуклеотидті микромассивтермен салыстыру. Мол Вис. 2003, 9: 482-496.

Ши Л, Тонг В, Фанг Х, Шерф У, Хан Дж, Пури РК, Фруе ФВ, Гудсаид FM, Гуо Л, Су З, Хан Т, Фуско Дж.К., Сю ЗА, Паттерсон Т.А., Хонг Х, Си К, Перкинс Р.Г. , Чен Дж.Дж., Кассиано Д.А.: Микромассив технологиясының кросс-платформалық салыстырмалылығы: платформа ішілік үйлесімділік және сәйкес деректерді талдау процедуралары маңызды. BMC биоинформатика. 2005, 6 Suppl 2: S12-10.1186/1471-2105-6-S2-S12.

Shippy R, Sendera TJ, Lockner R, Palaniappan C, Kaysser-Kranich T, Watts G, Alsobrook J: Коммерциялық қысқа-олигонуклеотидтік микромассивтердің өнімділігін бағалау және кросс-платформалық корреляция жасаудағы шудың әсері. BMC геномикасы. 2004, 5 (1): 61-10.1186/1471-2164-5-61.

Tan PK, Downey TJ, Spitznagel ELJ, Xu P, Fu D, Dimitrov DS, Lempicki RA, Raaka BM, Cam MC: коммерциялық микроаррей платформаларынан ген экспрессиясының өлшемдерін бағалау. Нуклеин қышқылдары Res. 2003, 31 (19): 5676-5684. 10.1093/nar/gkg763.

Yauk CL, Berndt ML, Williams A, Douglas GR: алты микромассив технологиясын жан-жақты салыстыру. Нуклеин қышқылдары Res. 2004, 32 (15): e124-10.1093/nar/gnh123.

Маккей IM, Arden KE, Nitsche A: вирусологиядағы нақты уақыттағы ПТР. Нуклеин қышқылдары Res. 2002, 30 (6): 1292-1305 жж. 10.1093/нар/30.6.1292.

Вонг ML, Medrano JF: мРНҚ мөлшерін анықтау үшін нақты уақыттағы ПТР. Биотехника. 2005, 39 (1): 75-85.

Arya M, Shergill IS, Williamson M, Gommersall L, Arya N, Patel HR: Нақты уақыттағы сандық ПТР негізгі принциптері. Сарапшы Аян Мол Диагн. 2005, 5 (2): 209-219. 10.1586/14737159.5.2.209.

Вильгельм Дж, Пингуд А: Нақты уақыттағы полимеразды тізбекті реакция. Хембиохим. 2003, 4 (11): 1120-1128. 10.1002/cbic.200300662.

Pietrzyk MC, Banas B, Wolf K, Rummele P, Woenckhaus M, Hoffmann U, Kramer BK, Fischereder M: Жедел бас тартумен бүйрек аллогранттарынан алынған биопсияларда лазерлік микродисекцияны қолдану арқылы фракталкиннің гендік экспрессиясының сандық талдауы. Transplant Proc. 2004, 36 (9): 2659-2661. 10.1016/j.transproceed.2004.09.029.

de Kok JB, Roelofs RW, Giesendorf BA, Pennings JL, Waas ET, Feuth T, Swinkels DW, Span PN: Ісік тіндеріндегі ген экспрессиясының өлшемдерін қалыпқа келтіру: 13 эндогендік бақылау гендерін салыстыру. Lab Invest. 2005, 85 (1): 154-159.

Хьюз ТР, Мао М, Джонс А.Р., Бурчард Дж, Мартон М.Дж., Шеннон КВ, Лефковиц С.М., Зиман М, Шелтер Дж.М., Мейер МР, Кобаяши С, Дэвис С, Дай Х, Хэ Ю.Д., Стефаниантс СБ, Кавет Г, Уокер В.Л. , West A, Coffey E, Shoemaker DD, Stoughton R, Blanchard AP, Friend SH, Linsley PS: Сиялы олигонуклеотидтер синтезаторымен жасалған микромассивтерді пайдаланып өрнек профилін жасау. Nat Biotechnol. 2001, 19 (4): 342-347. 10.1038/86730.

Стефано ГБ, Буррилл Дж.Д., Лабур С, Блейк Дж, Кадет П: морфинге жедел әсер еткен адам лейкоциттеріндегі әртүрлі гендердің реттелуі: экспрессиялық микроаррей талдауы. Med Sci Monit. 2005, 11 (5): MS35-42.

Zhao JR, Bai YJ, Zhang QH, Wan Y, Li D, Yan XJ: TaqMan-MGB зонд технологиясын пайдалана отырып, нақты уақыттағы ПТР арқылы В гепатиті вирусының ДНҚ-сын анықтау. Әлемдік J Гастроэнтерол. 2005, 11 (4): 508-510.

Янг DK, Kweon CH, Kim BH, Lim SI, Kim SH, Kwon JH, Han HR: Жапон энцефалитінің вирусын анықтауға арналған TaqMan кері транскрипциялық полимеразды тізбекті реакция. J Vet Sci. 2004, 5 (4): 345-351.

Раджагопалан Д: жоғары тығыздықтағы олигонуклеотидтер массивінің деректерін талдаудың статистикалық әдістерін салыстыру. Биоинформатика. 2003, 19 (12): 1469-1476 жж. 10.1093/биоинформатика/btg202.

Bolstad BM, Irizarry RA, Astrand M, Speed ​​TP: дисперсия мен ауытқуға негізделген жоғары тығыздықтағы олигонуклеотидтер массивінің деректері үшін қалыпқа келтіру әдістерін салыстыру. Биоинформатика. 2003, 19 (2): 185-193. 10.1093/биоинформатика/19.2.185.

Smyth GK, Speed ​​T: cDNA микромассив деректерін қалыпқа келтіру. Әдістері. 2003, 31 (4): 265-273. 10.1016/S1046-2023(03)00155-5.

Хубер В, фон Хейдебрек А, Султман Х, Поутка А, Вингрон М: Микромәліметтер калибрлеуіне және дифференциалдық өрнектің сандық көрсеткіштеріне қолданылатын дисперсияны тұрақтандыру. Биоинформатика. 2002, 18 Қосымша 1: S96-104.

Фосетт Т: ROC графиктері: зерттеушілер үшін ескертпелер мен практикалық ойлар. Техникалық есеп HPL-2003-4, HP зертханалары. 2004, [http://home.comcast.net/

Chambers JM, Hastie TH: Статистикалық модельдер. 1992, С. Уодсворт және Брукс/Коул, Тынық мұхиты тоғайы, Калифорния


Бейнені қараңыз: Полимеразная цепная реакция видео 2. Генная инженерия Молекулярная генетика (Мамыр 2022).